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人工智能、大數(shù)據(jù)助力新型冠狀病毒藥物研發(fā)

2020/02/06244

 日前,全球健康藥物研發(fā)中心(GHDDI)會(huì)同清華大學(xué)藥學(xué)院免費(fèi)將藥物研發(fā)資源開放給科研人員,共同加速新型冠狀病毒藥物研發(fā)。此次全球健康藥物研發(fā)中心開放的資源主要是針對(duì)能有效作用于新型冠狀病毒的藥物的研究,人工智能、大數(shù)據(jù)等新技術(shù)將發(fā)揮重要作用。

    具體來說,首先針對(duì)如何能在短期內(nèi)發(fā)現(xiàn)可能的有效藥物,用于迅速緩解當(dāng)前疫情,正在運(yùn)用“老藥新用”的研發(fā)手段,即通過篩選已經(jīng)過一期臨床實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的安全性有一定保證的藥物,加快候選藥物的研發(fā)速度;同時(shí)制定中長期的目標(biāo):研制更安全有效的藥物和疫苗,并加深科研界和公眾對(duì)冠狀病毒的認(rèn)知。

    針對(duì)“老藥新用”的目標(biāo),GHDDI已經(jīng)使用了3種互補(bǔ)的研發(fā)方案來尋找臨床上安全有效的藥物,也已經(jīng)找到了一些候選方案,正在進(jìn)行進(jìn)一步的確認(rèn)研究和排序,會(huì)將方案盡快提交國家相關(guān)機(jī)構(gòu)并協(xié)助推進(jìn)臨床研究。GHDDI早前已部署了相關(guān)團(tuán)隊(duì)并一直在為此工作,比如已經(jīng)上線的人工智能藥物研發(fā)平臺(tái)和大數(shù)據(jù)分享平臺(tái),就是由中心的人工智能研發(fā)團(tuán)隊(duì)支持運(yùn)作的,同時(shí)也正向社會(huì)上有研發(fā)基礎(chǔ)的科研人員或機(jī)構(gòu)免費(fèi)提供中心的高通量篩選平臺(tái)、多個(gè)化合物分子庫等優(yōu)質(zhì)資源,此外中心團(tuán)隊(duì)目前已經(jīng)搭建了多個(gè)新型冠狀病毒的靶點(diǎn)結(jié)構(gòu)模型并開展了一系列工作。

    從現(xiàn)有資源來看,我們并不能確定用于SARS和MERS的藥物是否能有效作用于此次病毒疫情。SARS、MERS和新型冠狀病毒都有一個(gè)和艾滋病毒相似的蛋白酶靶點(diǎn),目前討論比較多和可靠性較高的兩類已知藥物,一個(gè)就是針對(duì)艾滋病病毒HIV蛋白酶的抑制藥物,而另一個(gè)則是針對(duì)埃博拉病毒的一款新型核苷類似物抗病毒藥。這兩種藥物可能會(huì)對(duì)新型冠狀病毒的兩個(gè)不同靶點(diǎn)有作用,其中一種基于體外實(shí)驗(yàn)、動(dòng)物模型以及針對(duì)埃博拉病毒的臨床數(shù)據(jù)等各方面來看,比HIV藥物的可能性會(huì)大一些。但是否真的對(duì)于治療新型冠狀病毒有效,還需要進(jìn)一步驗(yàn)證。

    建議由國家權(quán)威機(jī)構(gòu)牽頭組建全國性診斷和治療藥物遴選專家組,從病毒特性、已有上市藥物藥理作用、中藥癥候辨證施治等角度對(duì)候選藥物進(jìn)行潛力排序,系統(tǒng)組織科研單位集中開展抗病毒活性篩選以及藥效評(píng)價(jià),加快藥物研發(fā)進(jìn)程。同時(shí)建立傳染病直報(bào)數(shù)據(jù)的跨部門協(xié)調(diào)和共享機(jī)制,例如國家藥品監(jiān)督管理局重點(diǎn)關(guān)注藥品真實(shí)世界使用數(shù)據(jù)和證據(jù)轉(zhuǎn)化應(yīng)用,為后續(xù)附條件批準(zhǔn)和特別審評(píng)程序批準(zhǔn)治療用藥械提供基礎(chǔ)證據(jù)支撐;利用傳染病網(wǎng)絡(luò)直報(bào)系統(tǒng)進(jìn)行患者流行病學(xué)調(diào)查和用藥方案回顧性分析,建立病例隊(duì)列,對(duì)傳染性變化趨勢(shì)、推薦診療方案用藥與非推薦診療方案用藥、中西藥聯(lián)合用藥與西醫(yī)單獨(dú)治療等進(jìn)行及時(shí)深入的回顧性比較研究,建立患者隊(duì)列,深入比較分析,發(fā)現(xiàn)有效的治療藥物、中藥聯(lián)合治療方法等。

    開發(fā)藥物有其客觀時(shí)間規(guī)律,一般需要5~10年,但“老藥新用”通??梢源蟠罂s短時(shí)間。目前GHDDI針對(duì)“老藥新用”的目標(biāo),已經(jīng)使用了3種互補(bǔ)的研發(fā)方案來尋找臨床上安全有效的藥物,也已經(jīng)找到了一些候選方案,正在進(jìn)行進(jìn)一步的確認(rèn)研究和排序。除了GHDDI團(tuán)隊(duì)做的研發(fā)工作以外,也聯(lián)合清華大學(xué)藥學(xué)院,免費(fèi)向社會(huì)上有研究基礎(chǔ)的科研人員和機(jī)構(gòu)開放了一系列先進(jìn)的內(nèi)部資源,比如人工智能藥物研發(fā)平臺(tái)和大數(shù)據(jù)分享平臺(tái)、高通量篩選平臺(tái)、多個(gè)化合物分子庫等,以期能給社會(huì)研發(fā)力量以支持。同時(shí)還在積極聯(lián)絡(luò)國內(nèi)外具有先進(jìn)技術(shù)和優(yōu)勢(shì)資源的研究人員和機(jī)構(gòu)聯(lián)合攻關(guān)。

    最近上線的人工智能藥物研發(fā)和大數(shù)據(jù)分享平臺(tái),里面涵蓋了既往冠狀病毒相關(guān)研究中涉及的900多個(gè)小分子在不同階段的相關(guān)實(shí)驗(yàn)信息等,2000多個(gè)冠狀病毒相關(guān)的文獻(xiàn)記錄以及原文鏈接,并且實(shí)時(shí)更新新型冠狀病毒的科學(xué)前沿報(bào)道,希望科研界能參與提煉有用信息并得到幫助或啟示,共同助力針對(duì)新型冠狀病毒的研究。再比如高通量篩選平臺(tái)和多個(gè)化合物分子庫,可以幫助科學(xué)家高效篩選出經(jīng)過臨床一期實(shí)驗(yàn)的安全性已知的化合物,有效縮短針對(duì)此次疫情的藥物研發(fā)時(shí)間。

    此外,GHDDI團(tuán)隊(duì)還根據(jù)新型冠狀病毒和SARS病毒的同源性建立了多個(gè)靶點(diǎn)結(jié)構(gòu)模型并開展了一系列分子動(dòng)力學(xué)模擬,計(jì)算化學(xué)藥物設(shè)計(jì),以及人工智能藥物設(shè)計(jì)工作,這些工作都在獲得新病毒基因序列之后幾天內(nèi)完成,為進(jìn)一步探索靶點(diǎn)機(jī)制,實(shí)現(xiàn)“老藥新用”的虛擬篩選,為后續(xù)的藥物設(shè)計(jì)和實(shí)驗(yàn)開發(fā)奠定基礎(chǔ)。

    針對(duì)新型冠狀病毒進(jìn)行研究,非常歡迎科研人員和機(jī)構(gòu)申報(bào)使用GHDDI的免費(fèi)研發(fā)平臺(tái),我們也會(huì)盡己所能去支持。在合作初期需要達(dá)成數(shù)據(jù)及時(shí)公開和同社會(huì)共享成果的共識(shí) ,同時(shí)GHDDI本身不追求利益,會(huì)竭盡全力提供服務(wù),目前所做的所有工作都是為了更快更有效的開發(fā)出針對(duì)新型冠狀病毒的藥物。

    通過一系列的研發(fā)工作和舉措,科學(xué)家希望能在短期內(nèi)找到有效的候選藥物,緩解當(dāng)下的疫情。從中長期來看,也能有效提升疾病研究、藥物研發(fā)領(lǐng)域的效率,并促進(jìn)國內(nèi)相關(guān)領(lǐng)域的發(fā)展。目前,GHDDI和科學(xué)界根據(jù)以往數(shù)據(jù)指導(dǎo)現(xiàn)今疫情,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)一些可能有效的藥物,但GHDDI正在進(jìn)一步驗(yàn)證和基于多層數(shù)據(jù)進(jìn)行嚴(yán)謹(jǐn)?shù)呐袛嗪团判?,候選藥物是否真正有效安全還需要進(jìn)一步臨床驗(yàn)證。

    作為科學(xué)家,我們將全身心投入解決目前面臨的問題,也獲得了相當(dāng)多的進(jìn)展,我們有信心和很大的希望能貢獻(xiàn)解決新型冠狀病毒的方案。另外,給公眾提個(gè)建議,如果條件允許,可以注射流感疫苗。疫情當(dāng)前,也是流感季,雖不能直接抵御新型冠狀病毒,但可以降低醫(yī)院負(fù)擔(dān),對(duì)身體也是一種保護(hù)。

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